Er is tot op heden geen efficiënte behandeling van zomereczeem. Corticosteroïden en antihistaminica kunnen gebruikt worden om de allergische reactie te onderdrukken. Het gebruik van corticosteroïden kan op lange termijn echter nadelen met zich meebrengen, zoals immunosuppressie, spieratrofie, osteoporose en laminitis, vooral wanneer ze systemisch worden toegediend. Lokale behandeling heeft daarom de voorkeur. Antihistaminica werken het best wanneer ze preventief toegediend worden voor het begin van het allergieseizoen. Ze werken veel minder eenmaal het allergieseizoen is begonnen. De combinatie van corticosteroïden met antihistaminica kan de dosis van de steroïden helpen reduceren.
Hypo- of desensibilisatie bestaat uit opeenvolgende antigeeninjecties, waarbij de dosis gedurende een aantal weken wordt opgedreven. Paarden met zomereczeem kunnen gedesensibiliseerd worden door regelmatige injecties met Culicoides antigen, maar de resultaten zijn erg wisselvallig. Omdat de relevante allergenen in Culicoides extract in een lage concentratie aanwezig zijn en het extract daarnaast nog verschillende andere substanties bevat, is het moeilijk om de dosis en de frequentie van injecties te standaardiseren.
Ook het aanpassen van de voeding (minder krachtvoer en eiwit) of het toevoegen van bepaalde voedingssupplementen (bv. omega-3/omega-6 vetzuren en nicotinamide) zou een gunstig effect hebben als (bijkomende) behandeling van zomereczeem bij paarden. Er dient nog verder onderzoek verricht te worden naar de optimale samenstelling van deze supplementen.
Daarnaast zijn er ook nog een aantal alternatieve behandelingsmogelijkheden beschreven, zoals homeopathie en acupunctuur. Wetenschappelijke gegevens die de werkzaamheid van deze alternatieve benaderingen aantonen ontbreken echter.
Het is belangrijk om contact met de Culicoides muggen zoveel mogelijk te vermijden. Er zijn echter geen goede insecticiden met een lange werking voor paarden beschikbaar. Men kan gebruik maken van pyrethroïden (permetrine, deltametrine) als spray of spot-on. Deze producten zijn niet geregistreerd voor het paard (wel voor runderen). Oormerken met pyrethroïden (gebruikt bij runderen) kunnen aangebracht worden in de manen of de staart. Pyrethroïden hebben echter een korte werking.
Preventief kan men de paarden opstallen tijdens de actieve periode van Culicoides (late namiddag en ‘s morgens). De stallen moeten vrijwel hermetisch afgesloten zijn en indien muggengaas gebruikt wordt voor de stalopeningen, moet zeer fijnmazig gaas (> 25 gaatjes/ cm2) gebruikt worden. Het gebruik van ventilatoren in de stal wordt eveneens aangeraden: Culicoides muggen zijn relatief slechte vliegers en zoeken vooral windstille plekken op.
Men kan ook een ‘eczeemdeken’ (al dan niet met masker) gebruiken als bescherming tegen de mugjes. Deze dekens geven doorgaans goede resultaten.
Verschillende oliën en vetten kunnen op de huid aangebracht worden om het ongemak te verlichten en als fysische barrière tegen de muggen. Toevoeging van citronella of andere plantenextracten zou een afwerend effect hebben op de mugjes, maar de werkzaamheid tegen zomereczeem werd niet wetenschappelijk aangetoond en uit enquêtes blijkt dat de klinische resultaten van deze lokaal aangebrachte producten sterk variëren. Eén van de redenen is dat door het zweten of door regenval de effectiviteit van deze producten vlug vermindert. Daardoor moeten deze producten frequent aangebracht worden, wat niet altijd praktisch haalbaar is.